去眼袋手术可能存在后遗症，但多数情况下症状轻微且可控。常见后遗症包括暂时性肿胀、淤青、干眼等，少数可能出现感染、瘢痕增生或下睑外翻。
术后早期可能出现局部肿胀和淤青，通常1-2周逐渐消退。部分患者会感到眼睛干涩，与暂时性睑板腺功能受影响有关，可通过人工泪液缓解。术中若损伤细小淋巴管可能引发长期水肿，但概率较低。少数体质敏感者可能出现切口处瘢痕增生，需配合抗瘢痕治疗。下睑外翻多与术中组织去除过量有关，需通过修复手术矫正。
极少数情况下可能发生球后血肿导致视力受损，或因麻醉意外引发全身并发症。选择经验丰富的医师可降低风险。术后需避免揉眼、剧烈运动，遵医嘱使用抗生素眼膏。保持伤口清洁干燥，睡眠时垫高头部有助于减轻肿胀。若出现持续疼痛、视力变化或异常分泌物，应立即复诊。
术后三个月内需严格防晒，避免瘢痕色素沉着。均衡摄入维生素C和优质蛋白有助于伤口修复。定期复查可及时发现并处理并发症，多数后遗症经规范处理可获得满意改善。