肠上皮化生通常不需要手术，多数情况下可通过药物治疗和定期随访控制病情。若出现重度异型增生或癌变倾向时，可能需要手术干预。
肠上皮化生是胃黏膜长期慢性炎症刺激导致的病理改变，主要表现为胃黏膜上皮被肠型上皮替代。轻度肠上皮化生属于可逆性病变，通过根除幽门螺杆菌感染、抑制胃酸分泌、保护胃黏膜等措施可有效改善。常用药物包括奥美拉唑肠溶片、胶体果胶铋胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片等，需在医生指导下规范用药并定期复查胃镜。
当肠上皮化生合并高级别上皮内瘤变、病理检查提示癌变风险显著增高时，医生可能建议内镜下黏膜切除术或外科手术切除病变组织。这种情况多见于长期未规范治疗、伴有重度萎缩性胃炎或反复出现消化道出血的患者。术前需通过染色内镜、超声内镜等评估病变范围，术后仍需持续随访监测。
肠上皮化生患者应避免进食腌制、烧烤等含亚硝酸盐食物，戒烟限酒，保持规律饮食。每6-12个月复查胃镜及病理活检，发现腹痛加重、黑便等异常症状及时就诊。合并幽门螺杆菌感染者需规范完成14天四联疗法，治疗后4周复查呼气试验确认根除效果。