激光祛肉痣一般不会留疤，但少数情况下可能出现色素沉着或轻微瘢痕。肉痣在医学上称为色素痣，激光治疗通过选择性光热作用破坏痣细胞，术后护理得当可降低留疤概率。
激光祛肉痣后皮肤会形成微小创面，愈合过程中若未感染且护理规范，新生表皮可完全覆盖治疗区域。表皮层损伤通常仅导致暂时性红斑或脱屑，1-2周后逐渐恢复。浅表性色素痣经1-2次治疗即可清除，术后配合医用敷料和防晒措施，多数人最终呈现与周围皮肤相近的外观。
部分特殊体质或治疗不当可能影响愈合效果。较深的复合痣或皮内痣需增加治疗次数，能量控制不当可能损伤真皮层导致瘢痕增生。术后搔抓、暴晒或接触污染物可能引发感染，形成色素异常或凹陷性瘢痕。瘢痕体质者治疗前需评估风险，必要时采用点阵激光等更精准的术式。
术后需保持创面干燥清洁，避免摩擦和紫外线照射，按医嘱使用重组人表皮生长因子凝胶等促修复药物。如出现明显红肿、渗液或瘢痕增生倾向，应及时复诊处理。选择正规医疗机构和经验丰富的操作者，能显著降低留疤风险。