复杂性肛瘘通常需要手术治疗，主要手术方式有肛瘘切开术、肛瘘切除术、挂线疗法、生物补片修复术、激光闭合术。
1、肛瘘切开术：
适用于低位单纯性肛瘘，通过切开瘘管使创面开放愈合。手术创伤较小，但可能损伤肛门括约肌功能，术后需配合坐浴和创面护理促进恢复。
2、肛瘘切除术：
适用于高位复杂性肛瘘，完整切除瘘管及周围瘢痕组织。该术式能彻底清除病灶，但创面较大愈合周期较长，需预防术后感染和肛门失禁等并发症。
3、挂线疗法：
采用弹性线材缓慢切割瘘管，适用于贯穿肛门括约肌的复杂性肛瘘。通过渐进式切割减少括约肌损伤，治疗周期约4-6周，需定期调整线材松紧度。
4、生物补片修复术：
使用生物材料填充瘘管腔隙，适用于复发型或深部肛瘘。具有保留肛门功能优势，但存在补片移位或排斥风险，术后需避免剧烈运动。
5、激光闭合术：
通过激光能量精确闭合瘘管内口，创伤小恢复快。对术者操作要求较高，可能需多次治疗，适合不能耐受传统手术的患者。
术后应保持肛门清洁，每日温水坐浴2-3次，饮食选择高纤维食物预防便秘，避免辛辣刺激食物。恢复期可进行提肛运动增强括约肌功能，3个月内禁止骑自行车或久坐。定期复查瘘管愈合情况，出现发热、剧烈疼痛或分泌物异常需及时就医。根据瘘管位置和个体差异，完全康复通常需1-3个月，复杂病例可能需分期手术。