口蹄疫病毒血清型主要包括O型、A型、C型、亚洲1型（Asia1）以及南非1型（SAT1）、南非2型（SAT2）、南非3型（SAT3）七类。其中O型、A型和亚洲1型在我国及周边地区较为常见。
1、O型：
O型是口蹄疫病毒中分布最广、流行最频繁的血清型，对牛、猪、羊等多种偶蹄动物均易感。该型病毒变异速度快，已发现多个拓扑型，疫苗防控需根据流行毒株及时更新。感染后动物表现为高热、口腔及蹄部水疱，严重时可导致幼畜死亡。
2、A型：
A型病毒主要影响牛和猪，其抗原性复杂，存在32个以上亚型。该型病毒可通过气溶胶远距离传播，暴发时需严格封锁疫区。临床症状包括流涎、跛行及产奶量骤降，部分亚型可能突破现有疫苗保护。
3、C型：
C型曾在我国及欧洲多次流行，但近20年检出率显著降低。该型对猪致病性较强，可引起蹄壳脱落等严重病变。由于全球防控力度加强，目前该型病毒已呈区域性消失态势。
4、亚洲1型：
亚洲1型（Asia1）主要分布于南亚和东亚地区，我国2009年后已无本土病例报告。该型对牛易感性最高，典型症状为舌面大面积溃疡。通过强制免疫接种，该型在我国已实现有效控制。
5、南非型：
南非1-3型（SAT1-3）主要流行于撒哈拉以南非洲，通过野生动物传播。SAT2型曾在中东地区造成跨洲传播，其衣壳蛋白VP1区段易发生重组变异。防控需加强边境检疫，避免通过动物制品输入。
针对口蹄疫病毒的多血清型特点，养殖场应建立常态化免疫程序，重点对O型、A型及亚洲1型进行三联苗接种。日常需严格执行生物安全措施，包括车辆消毒、人员隔离及饲料管控。发现疑似病例应立即上报兽医部门，对病畜实施扑杀和无害化处理。疫区周边需限制动物及产品流动，同时对受威胁区动物开展紧急免疫。饲养人员接触动物前后需用柠檬酸或过氧乙酸消毒，工作服应高温灭菌处理。