深脓疱疮通常不会自愈，需及时治疗防止感染扩散。治疗方法主要有外用抗生素、口服抗生素、局部清创、湿敷疗法、光动力治疗等。
1、外用抗生素
浅表性深脓疱疮可选用莫匹罗星软膏或夫西地酸乳膏等外用抗生素。用药前需用生理盐水清洁创面，每日涂抹两次以抑制细菌繁殖。对金黄色葡萄球菌和化脓性链球菌等常见致病菌有较好效果。用药期间需观察是否出现皮肤过敏反应。
2、口服抗生素
皮损范围较大或伴随发热时需口服头孢氨苄、阿莫西林克拉维酸钾等抗生素。这类药物能通过血液循环到达深部感染灶，对控制炎症扩散更有效。治疗期间须完成规定疗程，避免细菌产生耐药性。肝肾功能异常者需调整剂量。
3、局部清创
对已形成厚痂的溃疡面需进行专业清创处理。使用无菌器械去除坏死组织和脓性分泌物，暴露新鲜创面以促进愈合。清创后配合藻酸盐敷料可保持创面湿润环境。操作需在医疗机构由医护人员完成，避免继发感染。
4、湿敷疗法
急性渗出期可用硼酸溶液或乳酸依沙吖啶溶液进行冷湿敷。将6-8层无菌纱布浸透药液后敷于患处，每次15分钟每日3次。能减轻红肿疼痛并清除分泌物。湿敷后需及时擦干周围皮肤，防止浸渍。禁止使用酒精等刺激性液体。
5、光动力治疗
顽固性深脓疱疮可采用氨基酮戊酸光动力疗法。局部涂抹光敏剂后照射特定波长红光，能选择性破坏病原微生物而不损伤正常组织。需在专业皮肤科医师指导下进行，治疗后需避光48小时。该疗法对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染效果显著。
深脓疱疮患者日常应保持皮肤清洁干燥，避免搔抓导致细菌扩散。饮食需补充优质蛋白和维生素A、C促进创面修复，限制辛辣刺激性食物。衣物选择纯棉透气材质，定期消毒更换。出现发热、淋巴结肿大等全身症状时需立即就医。治疗期间严格遵医嘱用药，不可擅自停用抗生素。愈后需观察是否遗留瘢痕，必要时进行瘢痕修复治疗。