HPV-DNA阴性表示在检测样本中未发现人乳头瘤病毒的脱氧核糖核酸，通常提示当前未感染高危型HPV病毒。HPV-DNA检测主要用于筛查宫颈癌相关的高危型HPV感染，阴性结果可能受检测方法准确性、取样部位病毒载量、机体免疫状态等因素影响。
HPV-DNA检测采用分子生物学技术，通过扩增病毒特异性基因片段判断感染状态。阴性结果说明检测时宫颈分泌物或病变组织中不存在达到仪器敏感阈值的高危型HPV病毒核酸。常见的高危型HPV包括16型、18型、31型等14种亚型，这些型别与宫颈癌前病变和浸润癌密切相关。检测阴性时，仍需结合宫颈TCT细胞学检查综合评估，因少数情况下可能存在病毒载量过低或取样误差。
特殊情况下可能出现假阴性结果，如近期使用阴道药物影响取样质量、检测前72小时内进行阴道冲洗或性生活、病毒感染处于潜伏期尚未大量复制等。免疫功能低下者可能出现间歇性病毒脱落，导致单次检测阴性不能完全排除既往感染。对于有持续接触性出血等可疑症状者，即使HPV-DNA阴性也建议进一步阴道镜检查。
保持规律宫颈癌筛查仍是预防关键。30岁以上女性可每5年进行HPV-DNA联合TCT检测，或每3年单独进行TCT检查。日常注意避免多个性伴侣、使用安全套等防护措施，接种HPV疫苗可预防未感染的型别。发现HPV感染无须过度焦虑，多数为一过性感染，只有持续高危型感染才需密切随访。