长期过量服用羧甲司坦可能对胃肠、肝肾等器官造成损伤，但遵医嘱规范用药通常安全性较高。羧甲司坦主要用于慢性支气管炎、支气管哮喘等疾病引起的痰液黏稠，需严格遵循剂量与疗程。
羧甲司坦作为祛痰药，短期使用不良反应较少，可能出现轻度胃肠不适如恶心、腹胀。长期大剂量使用可能刺激胃黏膜，诱发胃痛或腹泻，部分患者可能出现头晕、皮疹等过敏反应。药物代谢依赖肝肾，长期超量可能增加肝肾负担，尤其肝肾功能不全者需谨慎。少数患者可能出现心悸或面部潮红，与药物扩张外周血管作用相关。
羧甲司坦的潜在危害多与用药不当相关。自行延长疗程或增加剂量可能掩盖原发病进展，如慢性阻塞性肺病急性加重未被及时发现。药物相互作用也需关注，与强效镇咳药联用可能导致痰液滞留，合并使用抗生素时可能影响后者疗效。孕妇及哺乳期妇女缺乏足够安全性数据，儿童用药需根据体重精确计算剂量。
使用羧甲司坦期间应定期监测肝肾功能，出现持续腹痛、尿量减少或皮肤黄染应及时就医。慢性呼吸道疾病患者需配合雾化、拍背排痰等物理疗法，避免单纯依赖药物。日常保持空气湿润，每日饮水1500-2000毫升有助于稀释痰液。若用药7天后症状未缓解，需重新评估诊断方案。