丙戊酸钠和丙戊酸镁的主要区别在于化学结构中的阳离子成分（钠/镁）及由此衍生的适应症差异，两者均为抗癫痫药，但丙戊酸镁更适用于合并高血压或需限钠的患者。
1、成分差异
丙戊酸钠的活性成分为丙戊酸与钠离子结合，每200毫克药物约含钠29毫克；丙戊酸镁则为丙戊酸与镁离子结合，不含钠成分。这种差异使得丙戊酸镁更适合需要严格限制钠摄入的心血管疾病患者。
2、适应症侧重
两者均用于癫痫全身性发作和部分性发作，但丙戊酸镁说明书明确标注对双相情感障碍的躁狂发作有治疗作用。丙戊酸钠在临床中更多用于儿童癫痫患者，因其剂型选择更丰富。
3、代谢影响
丙戊酸钠可能引起血钠升高，长期使用需监测电解质；丙戊酸镁则可能提升血镁浓度，肾功能不全者需谨慎。两者均需警惕肝功能损害、血小板减少等共同不良反应。
4、剂型区别
丙戊酸钠现有普通片、缓释片、糖浆、注射剂等多种剂型；丙戊酸镁目前主要为肠溶片剂型。注射用丙戊酸钠可用于癫痫持续状态的急救，而丙戊酸镁无静脉制剂。
5、药物相互作用
丙戊酸镁与含钙药物合用时可能形成不溶性沉淀，影响吸收；丙戊酸钠与利尿剂联用可能加剧钠潴留。两者均会显著升高苯巴比妥、拉莫三嗪的血药浓度。
使用丙戊酸盐类药物期间应定期监测血药浓度、肝功能和血常规，避免突然停药诱发癫痫发作。饮食上需保持均衡，限制高脂食物以减轻肝脏负担，服用丙戊酸镁者可适当增加饮水促进镁离子排泄。出现震颤、嗜睡或消化道出血等症状需立即就医。