阿比多尔和益生元通常可以一起吃，但需间隔2小时以上服用。阿比多尔是抗病毒药物，益生元是调节肠道菌群的膳食成分，两者无直接相互作用。
阿比多尔主要用于治疗流感等病毒感染，通过抑制病毒复制发挥作用。其代谢过程主要在肝脏完成，对胃肠道影响较小。益生元多为低聚糖类物质，如低聚果糖、低聚半乳糖等，可促进双歧杆菌等有益菌增殖。两者作用机制和代谢途径不同，联合使用一般不会降低药效或增加不良反应。但阿比多尔需空腹服用以保障吸收率，而益生元常与食物同服，建议分开服用以避免胃肠不适。
特殊情况下需谨慎：免疫功能严重低下者长期大剂量使用益生元时，可能影响抗病毒药物代谢；肠黏膜严重损伤患者同时服用可能加重腹胀症状。若需长期联合使用，建议在医生指导下调整益生元剂量。服用期间出现腹泻、皮疹等异常反应应及时就医。
日常服用时建议优先保证阿比多尔的用药时间，餐前1小时单独服用，益生元可安排在餐后或加餐时摄入。治疗期间注意观察排便情况，保持适量饮水，避免高脂饮食影响药物吸收。若存在慢性胃肠疾病或免疫系统疾病，用药前应咨询医生或药师。