急性肾小管间质性肾炎是否严重需结合病情判断，多数患者经及时治疗可完全恢复，少数可能进展为慢性肾功能不全。
急性肾小管间质性肾炎的严重程度与病因及治疗时机密切相关。药物过敏、感染等常见病因引起的早期病例，停用致病药物或控制感染后，肾功能通常在1-2周内逐渐恢复。此时肾小管上皮细胞水肿和间质炎症为可逆性改变，尿量减少、尿液颜色加深等症状可随治疗缓解。患者可能出现轻度蛋白尿和镜下血尿，但血肌酐升高幅度有限，肾小球滤过率下降程度较轻。
若延误诊治或存在持续致病因素，如长期接触肾毒性物质或合并糖尿病等基础疾病，肾间质纤维化风险显著增加。部分患者可能发展为慢性间质性肾炎，出现不可逆的肾小管萎缩和间质瘢痕形成。此类病例伴随持续性高血压、贫血及电解质紊乱，血肌酐水平进行性升高，最终需要肾脏替代治疗。老年患者或合并多器官功能障碍者预后更差。
建议出现少尿、水肿等症状时立即排查尿常规和肾功能，确诊后严格避免肾毒性药物。治疗期间需监测24小时尿量及体重变化，保持低盐优质蛋白饮食，每日饮水量控制在2000毫升左右。合并感染时应彻底清除病灶，使用抗生素时需根据肌酐清除率调整剂量。恢复期每3个月复查尿β2微球蛋白和肾脏超声，评估肾小管功能。