重组腺病毒疫苗与流感疫苗在作用机制、适用病毒类型和接种方式等方面存在明显区别。重组腺病毒疫苗主要通过腺病毒载体递送目标抗原基因刺激免疫反应，而流感疫苗则直接包含灭活或减毒的流感病毒抗原。
重组腺病毒疫苗利用改造后的腺病毒作为载体，将编码特定病毒蛋白的基因导入人体细胞，使细胞表达抗原并激活免疫系统。这类疫苗通常针对单一病毒设计，例如新冠疫苗中的腺病毒载体疫苗。其优势在于能诱导较强的细胞免疫，且生产工艺相对稳定。流感疫苗则分为灭活疫苗和减毒活疫苗两种主要类型，包含当年预测流行的流感病毒株抗原。灭活疫苗通过注射接种，适用于6月龄以上人群；减毒活疫苗采用鼻喷方式，适用于2-49岁健康人群。流感疫苗需每年接种以匹配变异毒株。
重组腺病毒疫苗可能引起注射部位疼痛、疲劳等反应，免疫功能低下者需谨慎使用。流感疫苗常见不良反应包括低热、肌肉酸痛，对鸡蛋过敏者存在接种限制。腺病毒载体疫苗可能存在罕见血栓风险，流感疫苗在极少数情况下可能诱发吉兰-巴雷综合征。两种疫苗的研发路径和生产工艺完全不同，腺病毒疫苗更适用于新兴传染病应急接种，流感疫苗则侧重季节性流行防控。
接种疫苗后需留观30分钟，出现持续高热或严重过敏反应应及时就医。日常保持充足睡眠和均衡饮食有助于增强疫苗效果。两类疫苗的接种间隔应不少于14天，具体接种方案需遵循当地疾控部门指导。有慢性疾病或免疫缺陷者接种前应咨询医生评估禁忌证。