手足口病通常不会留下后遗症，但少数情况下可能引起病毒性脑炎、心肌炎或神经源性肺水肿等严重并发症。手足口病主要由肠道病毒引起，常见于5岁以下儿童，建议患者及时就医。
手足口病多数情况下属于自限性疾病，症状表现为手、足、口腔等部位的疱疹或溃疡，伴随发热。经过7-10天的对症治疗和休息后，皮疹消退且无其他异常表现，通常不会对神经系统、心脏或呼吸系统造成长期损害。部分患儿可能出现指甲脱落或皮肤色素沉着，但这些变化多为暂时性，数月内可自行恢复。
极少数重症手足口病患儿因病毒侵袭中枢神经系统或心肌组织，可能遗留后遗症。病毒性脑炎可能导致运动障碍、认知功能下降或癫痫发作；心肌炎可能引起心律失常或心功能不全；神经源性肺水肿可能遗留慢性肺部病变。这些情况多见于肠道病毒71型感染，且与治疗延迟有关。
家长需密切观察患儿精神状态、呼吸和心率变化，若出现持续高热、呕吐、肢体抖动或呼吸急促等症状应立即就医。康复期注意补充优质蛋白和维生素，避免剧烈运动，定期复查心电图和脑电图。接种EV71疫苗可有效预防重症手足口病的发生。