CT通常不能直接查出神经性头痛，但可辅助排除器质性疾病。神经性头痛的诊断需结合临床表现和脑电图、经颅多普勒超声、颈椎X线、核磁共振等检查综合判断。
神经性头痛属于功能性头痛，主要与血管舒缩异常、神经递质紊乱或精神心理因素相关。CT检查对脑出血、肿瘤等结构性病变敏感，但对无器质性改变的神经性头痛显示效果有限。脑电图能捕捉异常脑电波，判断是否存在神经元异常放电；经颅多普勒超声可评估脑血管血流速度，辅助诊断血管痉挛性头痛；颈椎X线有助于发现颈椎退变对枕神经的压迫；核磁共振能更清晰显示脑组织及血管形态，排除颅内微小病变。这些检查需根据头痛特点选择组合，如搏动性头痛优先考虑经颅多普勒，伴随颈部僵硬的建议加做颈椎检查。
诊断神经性头痛时，医生会详细询问头痛部位、性质、持续时间及诱发因素，结合神经系统查体结果选择针对性检查。日常应记录头痛日记，包括发作时间、强度、伴随症状及用药效果，为诊断提供参考。保持规律作息、适度运动和心理调适有助于减少发作频率，若头痛持续加重或出现呕吐、视力变化等警示症状须及时复诊。