磁共振一般能检查胆道小结石，尤其是磁共振胰胆管成像技术对胆道系统结石的检出率较高。
胆道小结石通常指直径小于5毫米的结石，磁共振胰胆管成像利用水成像原理可清晰显示胆管结构，对小结石的敏感度优于普通超声检查。该技术无需注射造影剂即可通过三维重建观察胆管分支，能识别结石的位置、数量和梗阻程度。检查过程中无电离辐射，适合孕妇或对碘造影剂过敏者。多数情况下可检出2毫米以上的结石，对胆囊颈部或胆总管下段等隐蔽区域的小结石也有较好显示效果。
当结石体积过小或密度与胆汁相近时，可能出现假阴性结果。钙化程度低的胆固醇结石在磁共振图像上对比度较弱，可能被遗漏。胆管蠕动或呼吸运动产生的伪影也会干扰微小结石的识别。若临床高度怀疑胆道结石但磁共振未发现，可结合超声内镜或经内镜逆行胰胆管造影进一步确诊。
检查前需空腹4-6小时以提高图像质量，避免佩戴金属物品。胆道术后患者需提前告知医生体内是否有金属夹等植入物。发现结石后应根据大小和症状选择药物排石、内镜取石或手术治疗，定期复查监测结石变化。