服用小分子肽通常不会影响艾滋病检测结果。艾滋病检测主要针对病毒抗体或核酸，与小分子肽无直接关联。
艾滋病检测通过血液或唾液样本检测人类免疫缺陷病毒抗体或病毒核酸，检测原理与小分子肽的代谢途径无交叉。小分子肽作为蛋白质分解产物，经胃肠吸收后参与正常代谢循环，不会干扰免疫系统产生抗体的过程。目前没有证据表明肽类补充剂会改变抗体生成或病毒载量检测的准确性。常规检测前无须停用小分子肽，检测结果仍可反映真实感染状态。
若检测结果异常或存在高危行为史，建议重复检测或结合核酸检测确认。日常补充小分子肽时应注意选择正规产品，避免与抗病毒药物同服可能存在的相互作用，HIV感染者使用任何营养补充剂前应咨询主治医生。保持均衡饮食和规律作息有助于维持免疫功能，检测后需遵循专业机构提供的咨询建议。