手汗症手术可能引发代偿性多汗和手足干燥两种后遗症。手汗症通常由交感神经过度兴奋引起，手术通过切断胸交感神经链控制出汗，术后需关注皮肤护理与体温调节。
代偿性多汗是术后常见反应，表现为躯干、大腿等非手术区域出汗量显著增加。这与神经调节功能重组有关，部分患者可能出现夜间盗汗或进食时头面部出汗加重。症状轻重与个体差异相关，多数在术后3-6个月逐渐适应。保持环境温度稳定、穿着透气衣物有助于缓解不适。手足干燥则因汗腺分泌功能受抑制导致，约三成患者出现掌跖部皮肤皲裂、脱屑。需每日使用含尿素或乳酸的润肤剂，避免接触碱性清洁剂。严重者可并发接触性皮炎，出现瘙痒红斑时应及时皮肤科就诊。
极少数情况下可能发生霍纳综合征，表现为眼睑下垂、瞳孔缩小，与术中交感神经损伤相关。术后气胸发生率不足百分之一，多因胸膜破损导致，表现为突发胸痛和呼吸困难需立即处理。这两种并发症多见于早期开展手术的医疗单位，随着胸腔镜技术成熟已大幅减少。术前充分评估解剖变异、术中采用精准电凝技术能有效预防。
建议术后建立长期随访机制，前3个月每月复查自主神经功能。日常避免剧烈温度变化刺激，冬季使用加湿器维持室内湿度在40%-60%。若出现持续性心悸、体位性低血压等自主神经紊乱症状，需进行心率变异检测。饮食注意补充维生素B族和锌元素，有助于神经修复与皮肤屏障重建。术后6个月内禁止桑拿、高温瑜伽等可能诱发代偿性多汗的活动。