越橘叶黄素和蓝莓叶黄素各有优势，具体选择需根据个体需求决定。越橘叶黄素对视网膜保护作用更显著，蓝莓叶黄素则更侧重改善夜间视力。
越橘叶黄素和蓝莓叶黄素均含有丰富的花青素和叶黄素类物质，但成分比例存在差异。越橘叶黄素中飞燕草素和矢车菊素含量较高，这些成分能有效抑制视网膜光感受器细胞氧化损伤，对长期用眼人群更有益。蓝莓叶黄素中锦葵花素和芍药素比例更突出，这类成分可加速视紫红质再生，有助于提升暗适应能力。两者均能缓解视疲劳症状，但作用机制不同。越橘叶黄素通过增强视网膜毛细血管微循环发挥作用，蓝莓叶黄素则主要调节睫状肌收缩功能。
从吸收利用率来看，越橘叶黄素在肠道中的生物利用度略高，可能与其中特定糖苷结构有关。但蓝莓叶黄素对胃酸环境耐受性更好，适合胃肠敏感人群。部分研究显示蓝莓叶黄素与脂溶性维生素协同效应更明显，而越橘叶黄素与水溶性营养素配伍性更佳。需要注意两者均可能影响抗凝血药物效果，服用华法林等药物者需谨慎选择。
日常护眼可交替补充两种叶黄素，但单日摄入总量建议不超过20毫克。选择时应注意产品是否标注叶黄素酯含量，酯化形式生物利用度通常提高5-8倍。搭配深海鱼油或维生素E可增强抗氧化效果，但避免与钙剂同服影响吸收。建议每补充3个月后停用1个月，长期连续服用可能降低肠道自主吸收能力。