预防咽扁桃体炎最有效的方法主要有保持口腔卫生、增强免疫力、避免接触病原体、合理饮食、及时治疗呼吸道感染等。
1、保持口腔卫生
每日早晚刷牙并使用漱口水清洁口腔，减少口腔细菌滋生。定期更换牙刷，避免细菌残留。儿童需家长监督刷牙过程，确保清洁到位。饭后漱口可清除食物残渣，降低扁桃体感染概率。口腔卫生不良易导致细菌繁殖，诱发咽扁桃体炎。
2、增强免疫力
规律作息保证充足睡眠，每周进行适度有氧运动如快走或游泳。适当补充维生素C和锌元素，可通过食用柑橘类水果和坚果实现。免疫力低下人群可遵医嘱使用脾氨肽口服冻干粉等免疫调节剂。强健的免疫系统能有效抵御病原体入侵。
3、避免接触病原体
流感季节减少前往人群密集场所，必要时佩戴口罩防护。避免与呼吸道感染者密切接触，不共用餐具等个人物品。室内定期开窗通风，保持空气流通。病原体直接接触是咽扁桃体炎主要传播途径，需特别注意防护。
4、合理饮食
多摄入富含优质蛋白的鱼肉蛋奶和新鲜蔬菜水果，少食辛辣刺激食物。每日饮水量保持在1.5-2升，保持咽喉黏膜湿润。儿童应避免过量食用冰淇淋等冷冻食品。均衡营养有助于维持呼吸道黏膜屏障功能。
5、及时治疗呼吸道感染
出现感冒症状时尽早休息，可遵医嘱使用连花清瘟胶囊等药物。急性咽喉炎需及时就医，避免发展为扁桃体炎。慢性鼻炎患者应规范治疗，防止分泌物刺激扁桃体。呼吸道感染控制不及时易继发咽扁桃体炎。
预防咽扁桃体炎需建立健康生活习惯，注意气候变化时增减衣物，冬季保持室内适宜湿度。戒烟限酒减少咽喉刺激，教师等职业用嗓人群要注意声带休息。出现咽痛持续不缓解、发热等症状时，应及时到耳鼻喉科就诊，避免延误治疗。平时可定期进行咽喉检查，尤其是有扁桃体炎病史者更需重视预防。