骨化醇和维生素D3的主要区别在于化学结构、代谢途径及临床应用。骨化醇是维生素D2的活性形式，而维生素D3是胆钙化醇，两者在体内需经肝肾羟化后才能发挥生理作用。
1.化学结构差异
骨化醇（麦角钙化醇）的侧链含双键和甲基，来源于植物或酵母；维生素D3（胆钙化醇）侧链为饱和结构，主要由动物皮肤经紫外线合成。结构差异导致两者与维生素D结合蛋白的亲和力不同，维生素D3的结合稳定性更高。
2.代谢途径差异
骨化醇需经肝脏25-羟化酶转化为25-羟基维生素D2，再经肾脏1α-羟化酶生成活性形式1,25-二羟维生素D2。维生素D3同样需两次羟化，但其代谢产物1,25-二羟维生素D3与受体结合能力更强，半衰期更长。
3.生物利用度差异
维生素D3在提升血清25-羟基维生素D水平方面效率更高，相同剂量下其生物活性约为骨化醇的1.7倍。这与维生素D3与载体蛋白结合更紧密、降解速率更慢有关。
4.临床应用差异
骨化醇多用于治疗甲状旁腺功能减退、慢性肾病继发的维生素D缺乏；维生素D3更常用于普通维生素D缺乏的预防性补充。严重肝肾功能不全时，可直接选用骨化三醇（活性维生素D）替代治疗。
5.补充剂类型差异
骨化醇常见于处方药如骨化三醇软胶囊；维生素D3多为非处方补充剂，如维生素D3滴剂、维生素D3碳酸钙片。两者均可用于佝偻病、骨质疏松的辅助治疗，但维生素D3的日常补充安全性更优。
日常补充维生素D时，普通人群优先选择维生素D3制剂，其维持血药浓度的效果更稳定。慢性肾病患者需监测血钙磷水平，根据医嘱选择活性维生素D制剂。建议通过血清25-羟基维生素D检测评估补充效果，同时配合适量日照和含维生素D的食物如深海鱼、蛋黄等。