细菌性痢疾和阿米巴性痢疾的主要区别在于病原体、临床表现及治疗方式。细菌性痢疾由志贺菌属引起，阿米巴性痢疾则由溶组织内阿米巴原虫导致。
1、病原体差异
细菌性痢疾的病原体为志贺菌，属于革兰阴性杆菌，通过粪口途径传播。阿米巴性痢疾的病原体是溶组织内阿米巴，为单细胞寄生虫，通过摄入被包囊污染的水或食物感染。两者传播方式相似，但病原体生物学特性截然不同。
2、症状表现
细菌性痢疾起病急骤，表现为高热、腹痛、里急后重及黏液脓血便，每日排便可达数十次。阿米巴性痢疾起病较缓，典型症状为果酱样腥臭粪便，伴右下腹压痛，发热症状较轻，易形成慢性感染或肝脓肿等肠外并发症。
3、诊断方法
细菌性痢疾确诊需粪便培养出志贺菌，或核酸检测阳性。阿米巴性痢疾诊断依靠粪便镜检发现滋养体或包囊，血清学检测阿米巴抗体也有辅助价值。结肠镜检查中，阿米巴痢疾可见特征性烧瓶样溃疡，而细菌性痢疾多表现为弥漫性黏膜充血水肿。
4、治疗方案
细菌性痢疾首选氟喹诺酮类如左氧氟沙星片，或三代头孢如头孢曲松钠注射剂。阿米巴性痢疾需使用硝基咪唑类如甲硝唑片联合肠腔型阿米巴药如二氯尼特糠酸酯。两者均需注意补液治疗，但抗生素选择有本质区别。
5、预防措施
预防细菌性痢疾需注重食品卫生和手部清洁，目前无有效疫苗。阿米巴性痢疾预防重点在于饮用水煮沸消毒，感染者应隔离至症状消失。两者均需做好粪便管理，但阿米巴包囊对常规氯消毒有较强抵抗力，需特殊处理。
日常应注意饮食卫生，避免生食未洗净的蔬菜水果，饮用煮沸后的水。出现腹泻症状时及时就医，避免自行使用止泻药掩盖病情。慢性腹泻患者需完善肠镜检查，旅行归来出现腹泻需主动告知流行病学史。保持良好个人卫生习惯是预防两类痢疾的共同基础。