泡发后的银耳在冰箱冷藏保存4天后若未出现变质通常可以食用，但若出现异味、黏液或颜色异常则不建议继续食用。银耳含有较多水分和营养物质，不当储存易滋生细菌。
银耳泡发后在4℃冰箱中密封保存时，微生物繁殖速度会减缓。新鲜泡发的银耳质地应呈半透明胶质状，带有天然菌类清香。冷藏4天内若保存容器清洁干燥、未与其他食物交叉污染，且银耳未出现明显质地改变，经充分加热煮沸后仍可食用。建议将泡发银耳分装成小份冷冻保存更安全，每次取用后避免反复解冻。
若发现银耳表面产生滑腻感、散发酸腐味或颜色发黄发黑，表明已受微生物污染产生毒素。即使高温烹煮也难以完全破坏米酵菌酸等耐热毒素，食用后可能引发恶心呕吐、腹痛腹泻等食物中毒症状。部分人群食用变质银耳后可能出现过敏性休克等严重反应，免疫力低下者风险更高。
日常保存泡发银耳建议使用保鲜盒密封，冷藏不超过2天为宜。烹调前需观察是否有异常，充分清洗后彻底加热至100℃并保持沸腾15分钟以上。银耳羹等制品室温放置超过4小时应丢弃，避免椰毒假单胞菌等致病菌滋生。出现食用后不适需立即就医，保留食物样本便于检测溯源。