流感病毒不是冠状病毒，两者属于不同的病毒科。流感病毒属于正黏病毒科，而冠状病毒属于冠状病毒科。
流感病毒和冠状病毒在结构、传播方式及所致疾病上存在明显差异。流感病毒基因组由分节段的单股负链核糖核酸构成，表面分布血凝素和神经氨酸酶两种糖蛋白，主要引发季节性流行性感冒，症状包括突发高热、肌肉酸痛、乏力等呼吸道症状。冠状病毒基因组为不分节段的单股正链核糖核酸，外膜呈现特征性冠状突起，可导致普通感冒至严重呼吸道综合征等多种临床表现，典型症状以发热、干咳、呼吸困难为主。
虽然两者均通过飞沫和接触传播，但冠状病毒的环境稳定性更强，潜伏期更长。新型冠状病毒肺炎与流感的重症病例均可出现肺部炎症，但冠状病毒更易诱发细胞因子风暴和多器官功能障碍。从检测角度，流感可通过快速抗原检测初步筛查，冠状病毒感染需依赖核酸检测确诊。
日常预防需区分对待：流感疫苗需每年接种，目前冠状病毒疫苗以基础免疫和加强针为主。出现呼吸道症状时应及时进行病原学检测以明确诊断，避免混淆用药。对于老年人和慢性病患者，建议同时做好两种病毒的防护措施，在流行季节减少人群聚集并保持室内通风。