西葫芦冻了之后软了通常可以吃，但若出现变色、发黏或异味则不建议食用。冷冻会导致细胞结构破坏使质地变软，但低温能抑制微生物繁殖，未变质时营养流失较少。
西葫芦冷冻后细胞壁因冰晶形成而破裂，解冻后水分渗出导致质地软化，这是正常物理现象。低温环境能有效延缓氧化和腐败进程，只要储存时间不超过3个月且包装完好，未出现霉斑或酸腐气味，加热煮熟后仍可安全食用。冷冻西葫芦的维生素C和部分水溶性营养素会有损失，但膳食纤维、矿物质及胡萝卜素等成分保留率较高，适合炖煮或做馅料。
若西葫芦解冻后表皮发黑、切面渗出浑浊黏液或散发酒精发酵味，表明已滋生霉菌或腐败菌。冷冻仅能抑制微生物活性无法杀灭细菌，长期储存后李斯特菌等耐低温病原体可能繁殖，食用变质冻西葫芦会导致腹痛腹泻。尤其孕妇、儿童等免疫力较弱人群应避免食用外观异常的冷冻蔬菜。
处理冻软西葫芦时可切除局部变色部分，充分加热至100摄氏度以上维持5分钟以灭活潜在病菌。建议将新鲜西葫芦切块焯水后沥干再冷冻，分装为单次用量减少反复解冻。日常储存需保持冰箱冷冻室低于零下18摄氏度，与生肉海鲜分开放置避免交叉污染。