甲状腺功能减退一般能治好，但部分患者可能需要长期服药控制。甲状腺功能减退可能是自身免疫损伤、甲状腺手术、碘缺乏或过量、垂体病变等原因引起的，建议患者及时就医。
甲状腺功能减退的治疗效果与病因密切相关。由碘缺乏引起的甲状腺功能减退，通过补充碘剂或甲状腺激素替代治疗，多数患者可恢复正常功能。甲状腺手术后或放射性碘治疗导致的甲状腺功能减退，通常需要终身服用左甲状腺素钠片等药物替代治疗，但症状可完全控制。自身免疫性甲状腺炎引起的甲状腺功能减退，部分早期患者经免疫调节和甲状腺激素替代治疗后可能恢复功能，但中晚期患者多需长期服药。垂体病变导致的继发性甲状腺功能减退，在治疗原发病后甲状腺功能可能恢复正常。
少数先天性甲状腺功能减退或甲状腺发育异常患者，治疗效果可能不理想。某些特殊类型甲状腺炎如产后甲状腺炎、亚急性甲状腺炎伴发的暂时性甲状腺功能减退，多数可自行恢复。极少数甲状腺激素抵抗综合征患者，治疗效果可能欠佳。
甲状腺功能减退患者应遵医嘱规范用药，定期复查甲状腺功能。日常注意保持均衡饮食，适量摄入海带、紫菜等含碘食物，避免过量。保持规律作息，适度运动，避免过度劳累。出现乏力加重、浮肿、怕冷等症状加重时应及时就医调整治疗方案。育龄期女性患者计划怀孕前需咨询医生调整药物剂量。