低分子肝素钙与低分子肝素钠的主要区别在于抗凝活性和适用人群，两者均可用于预防和治疗血栓性疾病，但具体选择需根据患者个体情况决定。
低分子肝素钙的抗凝活性相对较低，适用于肾功能轻度受损或需要长期抗凝治疗的患者。其分子结构中的钙离子可能减少注射部位的疼痛感，临床常用于骨科手术后血栓预防或妊娠期抗凝治疗。低分子肝素钠的抗凝活性较高，起效更快，更适合急性血栓栓塞症的初始治疗，如深静脉血栓或肺栓塞。其钠盐形式可能导致注射部位淤青概率略高，但生物利用度更稳定。
两种药物均通过抑制凝血因子Xa发挥抗凝作用，但钙盐的代谢过程中对肾脏负担较小，而钠盐需通过肾脏清除。对于严重肾功能不全患者，低分子肝素钙可能是更安全的选择。两者均需根据体重调整剂量，且不能互换使用。注射时需注意轮换部位以避免局部不良反应，用药期间需定期监测凝血功能。
使用低分子肝素类药物期间应避免剧烈运动以防出血，同时注意饮食中维生素K的均衡摄入。若出现牙龈出血、皮下瘀斑等异常症状需及时就医。患者不可自行调整剂量或更换剂型，所有用药方案需严格遵循医嘱。