流行性感冒可能并发肺炎、心肌炎、脑炎、中耳炎、肌炎等疾病。流感病毒可直接侵犯或诱发免疫反应导致多系统损害，重症患者可能出现呼吸衰竭、心力衰竭等危重情况。
1、肺炎
流感病毒性肺炎多发生于老年或慢性病患者，表现为高热持续不退、咳嗽加剧、呼吸困难。继发细菌性肺炎常见于病程5-7天，多由肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌引起，需使用阿莫西林克拉维酸钾片、盐酸莫西沙星片、注射用头孢曲松钠等药物治疗。胸部X线可见斑片状浸润影。
2、心肌炎
流感相关心肌炎多见于青少年，表现为胸闷心悸、活动耐力下降，严重者可出现急性心力衰竭。心电图显示ST-T改变，心肌酶谱异常，需绝对卧床休息并使用辅酶Q10胶囊、曲美他嗪片等心肌营养药物。超声心动图可评估心功能受损程度。
3、脑炎
流感病毒性脑炎起病急骤，出现意识障碍、抽搐或局灶性神经体征。脑脊液检查可见淋巴细胞增多，头颅MRI可显示脑实质异常信号。治疗需使用注射用更昔洛韦、甘露醇注射液等抗病毒及脱水降颅压药物，重症需机械通气支持。
4、中耳炎
儿童流感患者易并发急性中耳炎，表现为耳痛、听力下降伴发热。耳镜检查可见鼓膜充血膨隆，可使用氧氟沙星滴耳液、头孢克洛干混悬剂等药物治疗。反复发作可能需鼓膜穿刺引流。
5、肌炎
流感后肌炎特征为小腿肌肉剧烈疼痛伴肌酸激酶显著升高，严重者出现横纹肌溶解导致急性肾损伤。治疗需大量补液碱化尿液，必要时进行血液净化，可使用布洛芬缓释胶囊缓解肌肉疼痛症状。
流感患者应卧床休息至体温正常48小时，每日饮水2000毫升以上，进食高蛋白流质饮食如牛奶、蒸蛋等。恢复期避免剧烈运动，儿童及老年人需监测心率、呼吸等生命体征。接种流感疫苗是预防并发症的有效手段，流行季节需做好手卫生及呼吸道防护。