流产后会导致一些远期并发症，不容忽视。
早产率及中期流产率均偏高:清官或人工流产后，常见的并发症为子宫颈损伤，内口损伤常常未被发现，而在以后妊娠时发生宫颈内口功能不全，引起早产或中期流产，胎膜早破发生率亦高。故钳刮术时，必须将宫颈扩张到较大程度，以免手术损伤颈管内口。
围生期胎儿死亡率增高:有些手术损伤了子宫内膜及子宫肌层，故再次妊娠时可发生胎盘血循环障碍而引起胎盘功能不全，致胎儿缺氧，生长迟缓，死胎、早产儿和新生儿死亡率均增加。
产前、产后出血率增高:由于子宫壁曾多次被搔刮，可能受到损伤，妊娠后影响胎盘种植，胎盘血循环障碍，或附着位置偏低，故产前出血率高。胎盘可能有粘连，以致产后剥离时间延长或需要人工剥离，亦可能因剥离不全而造成胎盘残留。
易发生新生儿溶血症:妊娠早期流产后，胎儿红细胞可通过胎盘组织而到达母血循环。如果母子有血型不合时，只要有0.25毫升血到达母体，即可能使母体产生抗体，在下一次妊娠时，可能发生新生儿溶血症。
异位妊娠:流产未及时处理或处理不当，将会造成许多妇女身体损伤、盆腔急性或慢性炎症，导致异位妊娠。输卵管的炎症是最常见引起宫外孕的因素。输卵管具有输送精子、摄取卵子及把受精卵运送到子宫腔的作用。炎症可以影响输卵管的管腔及把受精卵运送到子宫腔的作用。炎症可以影响输卵管的管腔及其周围组织，干扰受精卵正常运行，影响受精卵进入宫腔。当输卵管炎症时，首先侵犯输卵管上皮，引起输卵管内膜炎。但若炎症不十分严重，上皮未完全被破坏，宫腔未完全被堵塞，而黏膜皱襞有粘连，以致管腔变为狭窄而不规则。此时精子可以与卵子结合形成受精卵，然而较精子略大的受精卵要通过这种狭窄而不规则的通道就可能遇到阻碍。当受精卵尚未达宫腔，但已发育到一定程度，以致不得不在输卵管内着床。严重的输卵管内膜炎，经抗生素积极治疗，炎症被控制后，输卵管上皮未完全被破坏，管腔部分通畅，也会导致输卵管妊娠。覆盖输卵管皱襞的上皮被破坏，上皮细胞纤毛消失，或者由于皱襞粘连引起输卵管管腔的机械性梗阻，或者由于炎症侵犯输卵管管壁的肌层，形成瘢痕，纤维化，影响输卵管的蠕动，这些都可阻碍受精卵的正常运行，造成输卵管妊娠。流产后引起的盆腔炎常导致输卵管周围炎症，形成粘连或纤维带，都可使输卵管机械性扭曲或压迫管腔，影响输卵管的正常蠕动，阻碍受精卵的运行，使其就地着床，引起宫外孕。部分流产可引起子宫内膜异位，子宫内膜替代的部分输卵管内膜同样可供受精卵种植。子宫内膜组织也可侵入输卵管间质部，形成间质增厚、宫腔狭窄或阻塞，导致输卵管妊娠。流产刮宫可能损伤宫颈导致受精卵在子宫颈管内着床和发育。这是一种罕见而危险的异位妊娠，常发生难以控制的大出血、休克、感染及贫血，严重威胁患者的生命和健康。
继发不孕:流产后可以引起输卵管炎症，若炎症严重，引起输卵管管壁增厚、积水、积血、积脓，输卵管上皮被破坏，管腔完全阻塞，精子无法进入输卵管，不能妊娠。这是女性不孕症的重要原因。有的输卵管管腔虽然通畅，但内膜被炎症破坏，影响内膜细胞的纤毛运动，且因瘢痕形成使输卵管管壁僵硬，影响输卵管蠕动，亦可影响精子和卵子的相遇和运送而致不孕。也有的因输卵管周围的粘连影响输卵管伞端捡拾卵子造成不孕。另外，因异位妊娠不得不切除部分甚至整个输卵管而导致不孕。流产刮宫可引起宫颈损伤，官颈狭窄，官腔部分粘连以致不孕。部分流产可引起子宫内膜异位症，输卵管子宫内膜异位症导致管腔粘连、狭窄和阻塞。输卵管表面的病灶，通过瘢痕收缩可直接影响拾卵功能或引起输卵管近端闭锁。盆腔的病灶则通过所分泌过量的前列腺素，影响输卵管的输送功能。卵巢巧克力囊肿则可压迫输卵管管腔并改变输卵管与卵巢间的正常解剖关系。异位病灶尚可以使缩宫素分泌亢进，黄体功能不足，也是不孕的原因之一。
