肝静脉病变发病原因主要包括两方面：先天性和后天性因素。先天性因素是指胚胎时期或出生前后发生的肝脏发育异常，如肝静脉重建不良或缺血性损伤等。后天性因素则包括肝硬化、门静脉高压和肝动脉血流改变等。肝硬化是最常见的肝静脉病变发病原因之一，其主要是由慢性肝炎引起的肝脏纤维化和结构紊乱所导致的。而门静脉高压是由长期存在的门脉阻塞或门静脉血流受阻导致的，如肝血栓形成、门脉癌栓塞等。肝动脉血流改变也可能引起肝静脉病变，如炎症导致的肝动脉窦隙增宽或反流，以及肝动脉血栓形成等。肝静脉病变发病原因复杂多样，包括先天性异常和后天性疾病等多种因素的综合作用。
