引起褐色尿的原因是肾脏问题。褐色尿的出现一般是由于我们体内的血红蛋白分解代谢产物——胆红素溶解于尿液中所致。胆红素是由脾脏通过分解老旧的血细胞产生的，正常情况下，经过肝脏的作用，胆红素会与胆汁结合，进入小肠，然后排泄体外。然而，在某些情况下，胆红素无法被肝脏完全结合和排除，就会进入血液循环，并通过肾脏滤过，在尿液中表现为褐色。
引起褐色尿的主要原因可以归结为两类：一是肾小球疾病，如肾炎、肾小球肿瘤等；二是肾小管疾病，如肾小管酸中毒、肾结石等。这些疾病会导致肾脏对胆红素的排除能力降低，导致胆红素在尿液中堆积和着色。
对于引起褐色尿的肾小球疾病，如肾炎，它会导致肾小球上皮细胞受损，破坏了尿液中胆红素的正常排泄。而肾小管疾病，如肾结石，当结石阻塞肾小管时，不仅会引起尿液淤积，还会使胆红素在尿液中浓度升高，从而出现褐色尿的现象。
总的来说，肾脏问题是引起褐色尿的主要原因。上述肾小球和肾小管疾病导致了胆红素在尿液中的异常积聚，使尿液呈现出褐色。要及时发现并治疗这些肾脏问题，以避免对身体的进一步损害。任何出现尿液异常的情况，都应该及时就医做进一步检查和诊断。
