炎症。尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等男性下尿路感染是导致射精疼痛的最常见的原因;因为射精时，肌肉收缩对炎症病灶是一种机械刺激，可引起疼痛。精囊炎、附睾炎同样也会造成射精疼痛。
结石。男性尿路结石也是射精疼痛的常见原因。这是因为结石是一种硬性异物，射精时局部软组织收缩和蠕动，挤压结石而产生疼痛。结石严重者可继发感染使疼痛加剧。
肿瘤。附睾、精囊、输精管、前列腺或后尿道等处的肿瘤，阻塞射精通道，射精时因刺激也可引起疼痛。
其他原因。严重包茎，可能随着尿道收缩会引起射精疼痛;阴茎硬结症，可能在阴茎勃起时诱发疼痛，射精的疼痛加剧;尿道狭窄，精液排出不畅而导致射精疼痛。性生活过频会导致输精管、精囊以及尿道器官无菌性炎症，使这些器官充血、水肿，当射精时这些器官的肌肉收缩即导致疼痛。
男性患者就应当对射精痛有一个正确的认识，克服负面消极的不良因素，树立自信心，如此才能彻底消除因射精疼痛产生的焦虑、紧张与恐惧等精神因素。男性患者若是因为性交次数过于频繁而引发射精疼痛，则应注意节制房事。
