关于慢性溃疡性结肠炎的病因，目前国内外大多数学者都在研究，但病因并不十分肯定也不完全明确，主要与以下几种因素有关。第一饮食因素，如夏秋季节的痢疾肠炎饮食不洁是导致溃疡性结肠炎原因之一。第二遗传因素，有治疗统计发现父母患溃疡性结肠炎患者他的子女患病率肯定要增加。第三感染因素仍然是肠炎痢疾这些感染因素也易诱发溃疡性结肠炎。第四精神情志因素；第五环境劳累因素；六其他基础疾病诱发因素；如肿瘤等病它会诱发溃疡性结肠炎，这些因素导致机体免疫机能降低，抵抗力下降，而肠道炎性细胞的致炎因子和毒素侵蚀肠粘膜，导致大肠黏膜的充血水肿糜烂溃疡，最终形成慢性溃疡性结肠炎。近几年来国内外学者运用细胞分子学，对该病进行研究发现溃疡性结肠炎患者的免疫细胞多现异常，也就是免疫功能降低肠黏膜的细胞致炎因子而作用于免疫细胞，它出现交互反应，从而形成肠粘膜的炎症和溃疡。
