耳垂缺损发病的原因主要是由于胚胎发育过程中耳垂的形成异常造成的。在胚胎的发育过程中，耳朵的各个部分都是在特定的时期内形成的。然而，如果这个过程中出现了异常，就有可能导致耳垂缺损的发生。这种异常可能涉及耳朵的支架组织的发育失败或发育延迟。具体来说，耳垂的缺失可能是由于耳朵的胚芽没有形成或发育未完成所导致的。另外，一些遗传因素也可能与耳垂缺损的发生有关。

该疾病的发病原因还需要进一步研究。一些研究表明，环境因素和胚胎时期的其他异常也可能与耳垂缺损的发生有关。例如，母体在妊娠期间暴露于有害物质或药物，或身体处于激素水平异常的情况下，均可能对胚胎的耳垂发育产生影响。一些基因突变或染色体异常可能会导致耳垂的缺损。

耳垂缺损的发病原因主要是由于胚胎发育过程中耳垂形成的异常。这可能涉及耳朵支架组织的发育失败或发育延迟，以及遗传因素的作用。此外，环境因素和其他胚胎异常可能也会对该疾病的发生产生影响。然而，我们还需要进一步的研究来全面了解耳垂缺损的发病原因。