髌骨缺失或发育不良的主要原因是先天性因素或遗传因素造成的。

先天性因素是指在胎儿发育过程中，髌骨的形成出现问题所导致的。胚胎在发育过程中，髌骨是由髌股骨小体发育而来的。如果胚胎发育过程中髌股骨小体没有正确发育或完全缺失，就会导致髌骨缺失或发育不良。这可能与胚胎发育过程中的遗传基因突变或胎儿发育过程中的环境因素如感染、药物暴露等有关。

遗传因素也是导致髌骨缺失或发育不良的重要原因。髌骨的发育是受多个基因的调控，如果这些基因突变或变异，就会影响髌骨的正常形成。有研究发现，某些基因的突变或变异与髌骨缺失或发育不良有关，例如SALL1和TBX3基因。

除了先天性因素和遗传因素，其他因素也可能导致髌骨缺失或发育不良，如外伤或手术引起的髌骨切除、骨折未正确愈合引起的骨不连以及肿瘤、感染等疾病造成的髌骨缺失。

髌骨缺失或发育不良的主要原因是先天性因素或遗传因素，这与胚胎发育过程中髌股骨小体的正常发育以及遗传基因的正常调控有关。其他因素如外伤、手术、骨折未愈合、肿瘤等也可能导致髌骨缺失或发育不良。