新生儿出血症主要是因为维生素K缺乏所致。

由于母体内维生素K通过胎盘的通透性很低，只有十分之一的量到达胎儿体内，母亲产前应用抗凝药、抗结核药等，会干扰维生素K的储存或者影响其功能。由于母乳中维生素K含量少，远低于配方奶喂养，而母乳喂养儿容易发生维生素K缺乏。

新生儿刚出生时肠道尚没有细菌，或者使用广谱抗生素抑制了肠道正常菌群，就会导致维生素K合成不足。对于有先天性肝胆疾病、慢性腹泻这些情况均会影响维生素K的吸收。