椰子肉可以直接食用或加工成多种食品，主要有生吃、榨汁、炖汤、制作甜品、炒菜等方式。
1、生吃
新鲜椰子肉可直接挖出食用，口感清甜爽脆，富含优质蛋白和矿物质。椰子肉含有中链脂肪酸，易于消化吸收，适合作为零食补充能量。剥取时注意剔除附着在果肉上的棕色种皮，避免影响口感。
2、榨汁
将椰子肉与椰汁混合搅打可制成椰奶，过滤后得到浓郁椰浆。椰奶可替代牛奶用于咖啡或奶茶，乳糖不耐受者可选择饮用。制作时建议按1：1比例加水稀释，避免过于浓稠。
3、炖汤
椰子肉切块后与鸡肉、排骨等食材炖煮，能提升汤品鲜味。椰子肉中的天然油脂会使汤色乳白，建议炖煮时间控制在1-2小时。海南传统椰子鸡火锅即以椰子肉为汤底原料。
4、制作甜品
椰子肉可制作椰丝、椰蓉等烘焙原料，或加入西米露、芋圆等糖水。制作椰丝需将果肉刨成细条后烘干，注意保持60℃以下低温避免营养流失。椰子慕斯、椰奶冻等甜品也依赖椰子肉提味。
5、炒菜
东南亚菜系常将椰子肉切丝与虾仁、蔬菜同炒，搭配咖喱或沙爹酱调味。炒制前建议将椰子肉浸泡10分钟，防止高温烹饪导致脱水变硬。椰子肉中的膳食纤维有助于促进胃肠蠕动。
椰子肉需冷藏保存避免变质，开封后建议3天内食用完毕。胃肠功能较弱者应控制单次摄入量，每日不超过100克为宜。制作椰浆时可通过添加少量食盐提升风味层次，但高血压患者需注意控盐。椰子肉含较高热量，减肥人群需计入每日总热量摄入。选择椰青时可通过摇晃判断，汁液声音沉闷者果肉通常更饱满厚实。