椴木银耳与普通银耳在营养成分上存在一定差异，主要体现在多糖含量、氨基酸组成及微量元素等方面。椴木银耳通常多糖含量更高，氨基酸种类更丰富，而普通银耳更易获取且性价比高。
椴木银耳因采用椴木栽培，生长周期较长，其子实体积累的多糖类物质更为丰富，尤其是具有免疫调节功能的β-葡聚糖含量较高。氨基酸组成中，椴木银耳的必需氨基酸比例更接近人体需求模式，其中赖氨酸、精氨酸等含量突出。微量元素方面，椴木银耳的铁、锌等矿物质含量略高于普通银耳，这可能与其生长基质的矿物质渗透有关。
普通银耳多采用袋料栽培，生长周期短，产量大，其粗蛋白含量与椴木银耳相近，但多糖分子量相对较小。由于栽培环境可控，普通银耳的卫生指标更稳定，且价格仅为椴木银耳的三分之一到二分之一。从膳食纤维来看，两种银耳的差异不大，均含有较高比例的可溶性膳食纤维。
选择银耳时可结合需求考虑:追求营养强化可选择椴木银耳，建议每周食用2-3次，每次10-15克干品，搭配枸杞或红枣炖煮以促进多糖溶出；日常饮食则推荐普通银耳，注意选购色泽自然、无硫熏的产品。两类银耳均需充分泡发后烹调，避免与含鞣酸的食物同食影响蛋白质吸收。特殊人群如糖尿病患者应注意控制食用量，银耳羹建议不放糖或使用代糖调味。