百合固金汤与养阴清肺汤的主要区别在于组方功效与适应证不同，前者侧重肺肾阴虚导致的咳血咽干，后者针对燥热伤肺引起的干咳少痰。
百合固金汤由百合、生地黄、熟地黄、麦冬等组成，具有滋阴润肺、止咳止血的功效，适用于肺肾阴虚、虚火上炎引起的咳嗽痰中带血、咽喉燥痛、手足心热等症状。方中百合与二地黄协同滋养肺肾之阴，麦冬清心除烦，整体侧重下焦阴虚调理。
养阴清肺汤以玄参、麦冬、生地黄为主药，配伍薄荷、甘草等，功能养阴清肺、解毒利咽，主治燥热伤肺或白喉初起导致的咽喉肿痛、干咳无痰、鼻干唇燥等症。该方强调清解上焦燥热，玄参清热解毒力强，薄荷宣散风热，更适合外感燥邪或热毒初犯肺系的表现。
使用两类方剂前需经中医辨证，阴虚火旺者忌辛辣温燥食物，燥热伤津者宜多食梨、藕等润燥之品。服药期间出现腹泻或症状加重应停用，慢性病患者及孕妇须在医师指导下服用，不可自行配伍加减药材。