适量食用无花果干通常无害，但过量可能引发胃肠不适、血糖波动、过敏反应等问题。
无花果干含较高膳食纤维，过量食用可能刺激胃肠黏膜，导致腹胀或腹泻，尤其胃肠功能较弱者需控制摄入量。其天然糖分浓缩后升糖指数较高，糖尿病患者应谨慎食用以避免血糖快速升高。少数人群可能对无花果中蛋白酶成分过敏，食用后出现皮肤瘙痒或口腔黏膜水肿。无花果干在加工过程中可能添加亚硫酸盐作为防腐剂，敏感体质者摄入后或诱发哮喘发作。长期过量食用高糖分果干还可能增加龋齿风险，建议食用后及时清洁口腔。
建议每日食用无花果干不超过30克，优先选择无添加糖和防腐剂的产品，搭配坚果可延缓血糖上升。胃肠敏感者宜分次少量食用，过敏体质人群首次尝试需观察反应。食用后建议用含氟牙膏刷牙或漱口，减少糖分对牙齿的侵蚀。若出现腹痛、皮疹等不适症状应立即停食并就医咨询。