石榴榨汁时籽可以保留或过滤，具体处理方式需根据个人口感偏好和榨汁工具类型决定。
石榴籽含有丰富的膳食纤维、维生素E和亚油酸等营养成分，直接榨汁可保留更多营养。使用破壁机或高速搅拌机时，籽会被充分打碎融入果汁中，仅产生细微颗粒感，适合追求高膳食纤维摄入的人群。若使用普通榨汁机或手动压榨，籽可能残留较多渣滓，建议通过滤网过滤获得更顺滑口感。对于消化功能较弱者，过滤后的果汁能减少胃肠刺激。石榴籽外壳坚硬但无毒，少量误吞不会造成健康风险，儿童饮用时建议去籽或过滤以避免呛咳。
制作石榴汁时可选择成熟度高的软籽石榴品种降低颗粒感，榨汁后尽快饮用以减少营养流失。冷藏保存不宜超过12小时，饮用前可加少量柠檬汁防止氧化变色。胃肠敏感者应控制单次饮用量在200毫升以内，避免空腹饮用。若使用带籽榨汁方式，建议搭配香蕉、酸奶等黏稠食物共同搅拌，能改善口感并促进营养素吸收。日常储存石榴应置于阴凉通风处，避免潮湿导致霉变。