元芩具有清热解毒、泻火燥湿、止血安胎等功效，主要用于治疗肺热咳嗽、湿热泻痢、胎动不安等病症。
1、清热解毒
元芩性寒，能清除体内热毒，对肺热咳嗽、咽喉肿痛等症状有缓解作用。其有效成分黄芩苷可抑制多种病原微生物生长，常与金银花、连翘等配伍用于风热感冒。
2、泻火燥湿
对湿热引起的黄疸、泻痢有显著疗效，能促进胆汁分泌改善消化功能。临床常用元芩配伍黄连治疗胃肠湿热，缓解腹痛腹泻症状。
3、止血安胎
所含黄芩素可增强毛细血管抵抗力，用于胎漏下血等出血症状。孕妇出现先兆流产时，可在医生指导下与白术、桑寄生等配伍使用。
4、抗炎抗过敏
黄芩苷具有抑制组胺释放的作用，对过敏性鼻炎、湿疹等疾病有辅助治疗效果。外用可缓解皮肤红肿瘙痒，常制成洗剂或膏剂使用。
5、保肝利胆
能降低转氨酶水平，改善肝功能异常，对酒精肝、药物性肝损伤有保护作用。与茵陈蒿配伍可增强利胆效果，治疗胆囊炎。
使用元芩时需注意脾胃虚寒者慎用，长期服用可能引起食欲减退。建议在中医师指导下根据体质调整用量，服药期间避免辛辣油腻食物，孕妇使用前必须咨询专业医师。日常可配伍枸杞、红枣等平和药材中和寒性，煎煮时不宜超过15分钟以免有效成分破坏。