查出甲减怀孕可能对孩子有影响，但通过规范治疗可显著降低风险。甲状腺功能减退可能影响胎儿神经发育和生长，需在医生指导下调整用药并定期监测甲状腺功能。
妊娠期甲状腺功能减退未控制时，母体甲状腺激素不足可能导致胎儿脑发育迟缓、智力障碍或出生体重偏低。研究显示妊娠早期是胎儿神经系统发育关键期，此时母体游离甲状腺素水平不足可能造成不可逆损害。临床常见影响包括胎儿甲状腺肿、早产及新生儿呼吸窘迫综合征。规范治疗下多数孕妇可维持正常甲状腺功能，左甲状腺素钠片是妊娠期安全用药，需根据孕周调整剂量并每4-6周复查促甲状腺激素。部分孕妇可能出现药物剂量需求增加现象，这与妊娠期血容量扩张及胎盘激素对甲状腺的抑制作用有关。
少数合并甲状腺自身抗体阳性的孕妇，即使甲状腺功能在正常范围，其流产和早产概率仍高于普通孕妇。这类情况需更密切监测，必要时考虑小剂量左甲状腺素干预。极少数未确诊的严重甲减孕妇，可能发生胎儿死亡或先天性克汀病，但现代产检体系已大幅降低此类风险。妊娠期新发甲减多与碘缺乏或桥本甲状腺炎相关，产后甲状腺功能可能自行恢复。
妊娠期甲减患者应保证每日250微克碘摄入，优先选择加碘食盐和海带等富碘食物，避免过量摄入抑制甲状腺功能的十字花科蔬菜。建议每周进行150分钟中等强度运动如孕妇瑜伽或散步，维持体重增长在11-16公斤范围内。每月需检测促甲状腺激素和游离甲状腺素水平，分娩后6周应复查甲状腺功能。哺乳期继续服用左甲状腺素不影响婴儿健康，但需与补铁剂间隔4小时服用。出现心悸、手抖等甲亢症状或持续乏力、便秘等甲减症状加重时应及时就诊。