莲子百合具有养心安神、润肺止咳、健脾止泻等功效，常用于改善失眠多梦、肺燥咳嗽、脾虚泄泻等症状。
1、养心安神
莲子百合中的生物碱和苷类成分能调节中枢神经系统，缓解焦虑情绪，改善因心肾不交或阴虚火旺导致的失眠多梦、心悸怔忡。临床常与酸枣仁、柏子仁配伍使用，如天王补心丹。
2、润肺止咳
百合含黏液质和皂苷，能滋润呼吸道黏膜，减轻干咳无痰或痰中带血等肺燥症状。对于慢性支气管炎、肺结核引起的咳嗽，可配伍川贝母、麦冬制成百合固金汤。
3、健脾止泻
莲子富含淀粉酶抑制剂和鞣质，能抑制肠道蠕动过度，改善脾虚引起的慢性腹泻。常与山药、芡实同用，如参苓白术散。需注意实热积滞型腹泻不宜使用。
4、抗氧化
两者均含多酚类物质，能清除自由基，延缓细胞衰老。实验显示其提取物可提升超氧化物歧化酶活性，对预防动脉硬化、老年痴呆有一定辅助作用。
5、调节免疫
百合多糖和莲子蛋白能促进淋巴细胞增殖，增强巨噬细胞吞噬能力。在肿瘤放化疗后辅助应用，有助于改善免疫功能低下状态。
日常食用可将莲子百合与银耳、枸杞炖煮成羹，每周食用2-3次为宜。脾胃虚寒者应减少生食，糖尿病患者需控制摄入量。出现持续咳嗽或严重腹泻时，应及时就医排除器质性疾病，不可单纯依赖食疗。