有蛀牙一般可以矫正牙齿，但需要先治疗蛀牙。蛀牙未治疗时可能影响矫正效果或导致疼痛加重，建议在正畸前完成龋齿充填或根管治疗。
龋齿处于早期浅龋阶段时，牙医可能直接进行树脂充填后开始正畸治疗。此时龋坏未累及牙髓，充填体与托槽粘接效果稳定，矫正过程中需加强口腔清洁防止继发龋。若龋齿已引发牙髓炎或根尖周炎，必须先完成根管治疗并观察1-2周，待炎症消退后再粘接托槽。急性炎症期强行矫正可能加重疼痛并影响牙槽骨改建。
深龋伴牙体大面积缺损时，需评估剩余牙体组织强度。缺损超过牙冠1/3的患牙，建议先进行嵌体或全冠修复再矫正，避免矫治力导致牙体折裂。对于需拔牙矫正的病例，优先考虑拔除严重龋坏的牙齿，既解决拥挤问题又去除病灶牙。隐形矫正患者更需提前处理龋齿，因为矫治器形成的密闭环境会加速龋病发展。
正畸期间要使用含氟牙膏配合牙缝刷清洁托槽周围，每餐后使用冲牙器清除食物残渣，避免食用粘性糖果等致龋食物。建议每3个月进行专业涂氟并复查充填体完整性，发现托槽周围脱矿或新发龋齿应及时处理。选择有正畸经验的牙医进行全程管理，既能保证矫正效果又可预防龋病进展。