激光治疗近视的危害通常不严重，但存在少数并发症风险。该手术通过改变角膜曲率矫正视力，多数患者术后恢复良好，可能出现干眼症、眩光等轻微不适，极少数情况下可能发生角膜感染或视力回退。
激光近视矫正手术已发展成熟，术中采用精确的计算机控制，切削角膜厚度误差可控制在微米级别。术后常见暂时性干眼症状与夜间眩光，多与角膜神经修复周期相关，3-6个月内逐渐缓解。规范使用人工泪液、避免强光刺激可有效改善。角膜瓣相关并发症概率极低，新型全飞秒技术已避免传统制瓣风险。术前严格筛查圆锥角膜等禁忌证，术后遵医嘱使用抗生素滴眼液，能显著降低感染风险。
少数患者可能因个体差异出现矫正不足或过矫，需二次增效手术。高度近视者术后存在视网膜脱离潜在风险，与手术本身无直接关联，而是近视眼底病变的自然进展。术后不规范用眼可能导致视力回退，但回退幅度通常不超过原度数的20%。严重并发症如角膜扩张发生率不足万分之一，多与术前评估疏漏有关。
术后需严格遵循防护要求：一个月内避免游泳、揉眼等行为，外出佩戴防紫外线眼镜；按医嘱使用氟米龙滴眼液等抗炎药物，定期复查角膜愈合情况；保持用眼卫生，每用眼40分钟休息5分钟，夜间睡眠佩戴防护眼罩；饮食注意补充维生素A和欧米伽3脂肪酸，如胡萝卜、深海鱼等食物有助于泪液分泌。出现眼红、剧痛或视力骤降需立即就医。