近视眼手术可能出现副作用，但多数较轻微且可控。常见副作用包括干眼、眩光、夜间视力下降等，严重并发症概率较低。
近视眼手术后干眼是较常见的反应，与角膜神经暂时性损伤有关，多数在3-6个月内逐渐缓解。术后早期可能出现视物模糊或视力波动，通常1-2周内稳定。部分患者会经历夜间眩光或光晕现象，尤其在暗环境下驾驶时需注意安全。极少数情况下可能出现角膜感染或角膜扩张等严重问题，需立即就医处理。术后需严格遵医嘱使用眼药水并定期复查，避免揉眼或过度用眼。
特殊情况下，如高度近视或角膜较薄患者，术后可能出现回退或视力矫正不理想。存在自身免疫性疾病、严重干眼症等基础疾病的患者并发症风险相对较高。术后角膜生物力学改变可能影响未来其他眼部手术的选择。严格术前筛查可显著降低严重副作用发生概率，但无法完全避免个体差异导致的异常反应。
术后需遵医嘱使用人工泪液缓解干眼，避免游泳、桑拿等可能引发感染的活动，外出佩戴防紫外线眼镜保护角膜。保持规律作息和适度用眼间隔，每用眼40分钟应远眺休息5分钟。术后1个月内避免剧烈运动或对抗性运动，防止眼部外伤。饮食上多摄入富含维生素A、叶黄素的食物如胡萝卜、菠菜等，有助于角膜修复。若出现持续眼红、疼痛或视力骤降等异常症状，应立即返院检查。