肛瘘手术一般需要30-60分钟，具体时间与瘘管复杂程度、手术方式等因素有关。
单纯性低位肛瘘手术时间通常在30-40分钟，这类瘘管位置表浅且分支较少，术中仅需切开瘘管并清除感染灶即可。复杂性高位肛瘘可能耗时40-60分钟，因瘘管走行深且存在多支瘘道，需配合探针定位或影像引导。采用传统切开术式较快捷，而挂线疗法或皮瓣推移术因操作精细会延长10-15分钟。术中若发现隐匿性脓腔需扩大清创，或遇活动性出血需止血处理，可能额外增加5-10分钟操作时间。麻醉生效时间与术前消毒准备通常不计入手术时长。
术后需保持会阴清洁干燥，每日用温水或高锰酸钾溶液坐浴2-3次，每次10-15分钟；饮食选择易消化的粥类、面条等半流质食物，避免辛辣刺激及油腻饮食；卧床时采用侧卧位减轻创面压迫，2周内避免久坐或剧烈运动；按医嘱定期换药并观察分泌物性状，若出现发热、剧烈疼痛或异常出血应及时复诊；术后1个月复查评估愈合情况，3个月内禁止骑自行车等会阴部受压活动。