肛瘘手术后恢复时间通常为4-6周，具体恢复周期与手术方式、创面大小及个人体质有关。
肛瘘手术后的恢复过程可分为三个阶段。术后1-2周为急性期，此时创面渗液较多，需每日换药并保持会阴清洁，避免剧烈运动或久坐压迫伤口。术后3-4周进入愈合期，创面逐渐缩小，渗液减少，可逐步恢复轻体力活动，但仍需避免辛辣刺激饮食。术后5-6周为巩固期，多数患者创面完全愈合，但深层组织修复仍需时间，建议继续使用高锰酸钾坐浴促进血液循环。传统切开术因创面较大可能需6周恢复，而挂线术或激光手术因创伤较小可能缩短至4周。高龄、糖尿病或免疫力低下患者恢复时间可能延长。
术后恢复期间应保持高纤维饮食如燕麦、西蓝花等预防便秘，每日饮水不少于1500毫升，便后使用温水清洗肛门。避免骑自行车、深蹲等增加肛周压力的动作，可进行散步等低强度运动。若出现发热、持续出血或剧烈疼痛需及时复诊。术后1个月、3个月需定期复查评估愈合情况，6个月内禁止负重劳动或长时间驾驶。