腰椎间盘突出手术可能存在后遗症，但发生概率较低。常见后遗症包括神经根粘连、硬膜外血肿、椎间隙感染等，多数可通过规范操作和术后管理避免。
腰椎间盘突出手术后神经根粘连可能与术中神经牵拉或术后瘢痕形成有关，表现为下肢放射性疼痛或麻木加重，可通过康复锻炼和药物干预缓解。硬膜外血肿通常因术中止血不彻底导致，术后24-48小时内出现剧烈腰痛伴下肢肌力下降，需紧急手术清除血肿。椎间隙感染多由细菌侵入引起，术后1-2周出现持续发热和椎体叩击痛，需长期抗生素治疗。
极少数情况下可能发生脑脊液漏，因硬脊膜破损导致头痛和切口渗液，需卧床制动及硬膜外血贴治疗。术后复发与患者自身椎间盘退变程度相关，新型微创技术可将复发率控制在较低水平。术中神经损伤概率不足百分之一，多数为可逆性感觉异常。
术后应严格遵循医嘱进行康复训练，初期避免弯腰搬重物，使用腰围保护3-6个月，逐步增加腰背肌功能锻炼如五点支撑法、游泳等低冲击运动。保持正常体重减轻腰椎负荷，睡眠选择硬板床配合腰部垫枕，坐姿保持脊柱直立且不超过1小时。饮食注意补充蛋白质和钙质促进组织修复，定期复查MRI观察手术区域恢复情况，出现异常疼痛或功能障碍需及时返院评估。