药流通常不适合存在宫外孕、严重贫血、长期服用糖皮质激素、肾上腺皮质功能不全、青光眼等疾病的患者，以及对米非司酮或米索前列醇过敏者。
1、宫外孕
宫外孕是指受精卵在子宫腔外着床发育，常见于输卵管。药流对宫外孕无效，强行使用可能导致输卵管破裂引发大出血。患者通常有停经后阴道流血、下腹剧痛等症状，需通过超声和血HCG确诊。治疗需紧急手术，如输卵管切除术或保守性手术。
2、严重贫血
血红蛋白低于70g/L的严重贫血患者，药流后可能出现大出血加重贫血，甚至导致休克。这类患者需先纠正贫血，可输注浓缩红细胞或服用硫酸亚铁片、琥珀酸亚铁片等铁剂，待血红蛋白回升后再评估终止妊娠方案。
3、长期用激素者
长期使用泼尼松片、地塞米松片等糖皮质激素的患者，下丘脑-垂体-肾上腺轴受抑制，药流使用的米非司酮可能加重肾上腺功能不全。这类患者需内分泌科会诊调整激素用量，通常建议选择人工流产。
4、青光眼患者
米索前列醇可能引起眼压升高，诱发急性闭角型青光眼发作。患者会出现眼痛、视力骤降、头痛呕吐等症状。有青光眼病史者应禁用，可改用其他终止妊娠方式，术后需监测眼压变化。
5、药物过敏
对米非司酮片或米索前列醇片过敏者可能出现皮疹、呼吸困难甚至过敏性休克。用药前需详细询问过敏史，发生过敏反应需立即停用并给予氯雷他定片、地塞米松磷酸钠注射液等抗过敏治疗。
药流后需卧床休息1-3天，2周内禁止盆浴和性生活，每日清洁会阴部。饮食宜多摄入猪肝、菠菜等富铁食物，配合维生素C促进铁吸收。术后出现发热、持续腹痛或出血量超过月经量需立即就医。药流后7-10天必须复查超声确认妊娠组织是否排净，未排净者需行清宫术。此后应采取可靠避孕措施，6个月内避免再次妊娠。